Python EnsemblRelease 模块
根据染色体条目,碱基位置确定基因
from pyensembl import EnsemblRelease
# release 77 uses human reference genome GRCh38
data = EnsemblRelease(77)
# will return ['HLA-A'] contig就是chr6的6(染色体id)
gene_names = data.gene_names_at_locus(contig=6, position=29945884)
# get all exons associated with HLA-A
exon_ids = data.exon_ids_of_gene_name('HLA-A')
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