注意，以下许多网站需要科学上网才能访问
常见文件格式的官网
DICOM官网： https://www.dicomstandard.orgNIfTI官网： https://nifti.nimh.nih.gov
通常
DICOM文件后缀为dcm，NIfTI文件后缀为nii或nii.gz(压缩过的nii文件)。后文将DICOM简写为dcm，NIfTI简写为nii
读写和格式转化
| 名称 | 类型 | 描述 | 官网 |
|---|---|---|---|
pydicom |
Python 库 |
读写 dcm |
https://pydicom.github.io |
nibabel |
Python 库 |
读写 nii |
https://nipy.org/nibabel |
dicom2nifti |
Python 库 |
dcm 转 nii |
https://github.com/icometrix/dicom2nifti |
dcm2niix |
命令行工具 | dcm 转 nii |
https://github.com/rordenlab/dcm2niix |
可视化
常用的库： vtk vtkjs OpenCV matplotlib
| 名称 | 类型 | 特点 | 官网 |
|---|---|---|---|
| DICOM Web Viewer | 浏览器 | 轻量 | https://ivmartel.github.io/dwv/ |
| Paraview-Glance | 浏览器 | 强大 | https://kitware.github.io/paraview-glance/nightly |
| itk-vtk-viewer | 浏览器 | https://kitware.github.io/itk-vtk-viewer/app | |
| ITK-SNAP | 桌面应用 | 轻量 | http://www.itksnap.org |
| 3D Slicer | 桌面应用 | 强大 | https://www.slicer.org |
https://medevel.com/14-best-browser-web-based-dicom-viewers-projects 推荐了一些基于浏览器的
dicom viewer，不过有些软件看起来好像已经很久没有维护了，此类软件不推荐使用
组织机构
- https://www.kitware.com/platforms
- https://www.mitk.org
- Open Health Imaging Foundation https://ohif.org， 相关 demo
PACS
Picture Archiving and Comunication System 的缩写
Orthanc一个开源的PACS软件，官网 https://www.orthanc-server.com- https://medevel.com/10-open-source-pacs-dicom 搜集了一些开源
PACS
其他
- https://idoimaging.com 收录了许多医疗图像相关的软件
NVIDIA公司推出的模型训练平台Clara： https://docs.nvidia.com/clara/tlt-mi/clara-train-sdk-v3.0/aiaa/key_features.html，可以方便地用来训练分割模型，提高医学图像的标注效率- 放射学相关： https://www.radiomics.io
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